Devoir séance 4

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Ceci est le début de la deuxième moitié du contrôle continu qui sera à déposer sur Moodle au plus tard le 24/11/2024 à minuit. Cette partie correspondant à la séance 4 du contrôle continu qui combinera les exercices à faire entre les séances. Pour cela:

• Créez un nouveau script R que vous sauvez immediatement sous le nom de Script_controle_continu2_numéro_étudiant.R en remplaçant numéro_étudiant par votre propre numéro.

• Chargez le package tidyverse(en utilisant library())

• Définissez votre répertoire de travail dans le dossier session4_organisations (en utilisant setwd())

• Importez le tableau Cheng_2021_Arabidopsis_N.txt en utilisant la bonne fonction et gardez le dans l’objet nitrate_data. Notez que chacun des exercices suivants est indépendant des autres

• Exercice 1 : Selectionnez toutes les colonnes de l’objet nitrate_data sauf la colonne Nlevel.

• Exercice 2 : Gardez uniquement les lignes de l’objet nitrate_data qui sont l’accession Col-0.

• Exercice 3 : En utilisant %>% afin de ne pas créer d’objet intermédiaire, effectuez la suite d’opérations suivantes:

1. Créez la colonne AppliedN_g, à partir de la colonne AppliedN_mg qui contient, en grammes (au lieu de milligrammes) la quantité d’azote utilisée dans le traitement.
2. Créez la colonne NUE qui contient la valeur d’efficacité d’utilisation d’azote qui est mesurée avec la formule suivante:
   Poids sec des plantes (en gramme) / quantité d’azote utilisée dans le traitement (en gramme)
3. Selectionnez les lignes correspondant au premier répliqua
4. Effectuez un boxplot de la NUE en fonction de l’accession, avec l’intérieur des boxplots colorés en fonction de la quantité d’azote utilisée dans le traitement (Nlevel).

Formulez une interprétation à propos de l’effet du la concentration en azote sur l’efficacité d’utilisation d’azote des plantes d’Arabidopsis.

• C’est fini. N’oubliez pas de sauver votre fichier que vous réutiliserez pour le reste du contrôle continu.